Universitas Maritim Raja Ali Haji memiliki pelbagai program Studi Sarjana dan Pascasarjana yang tersebar di Enam Fakultas dan Program Pascasarjana. Program Sarjana S1 Fakultas Teknik dan Teknologi Kemaritiman Teknik Informatika Teknik Elektro Teknik Perkapalan Kimia Teknik Industri Teknik Sipil Perencanaan Wilayah dan Kota Arsitektur Fakultas Ekonomi dan Bisnis Maritim Akuntansi Manajemen Bisnis Digital Kewirausahaan Fakultas Ilmu Kelautan dan Perikanan Ilmu Kelautan Manajemen Sumberdaya Perairan Budidaya Perairan Teknologi Hasil Perikanan Sosial Ekonomi Perikanan Fakultas Keguruan dan Ilmu Pendidikan Pendidikan Bahasa dan Sastra Indonesia Pendidikan Bahasa Inggris Pendidikan Matematika Pendidikan Biologi Pendidikan Kimia Pendidikan Fisika Pendidikan Profesi Guru (Profesi) Fakultas Ilmu Sosial dan Ilmu Politik Ilmu Pemerintahan Administrasi Publik Sosiologi Ilmu Hukum Hubungan Internasional Kajian Film, Televisi, dan Media Fakultas Kedokteran Kedokteran Pendidikan Profesi Dokter Program Pasca Sarjana S2 Magister Administrasi Publik Magister Ilmu Lingkungan Magister Pedagogi Magister Ilmu Pemerintahan Magister Manajemen
